En el museo se exponen fotografías, diagramas, dibujos, imágenes sacras, tallados, objetos históricos de antes y durante la restauración del conjunto misional, que reflejan la historia arquitectónica de este monumento.Entre los principales atractivos están: la sala de restauración, salón Guarayo, salón Chiquitos, salón Hans Roth. Se encuentra ubicado frente a la plaza principal y cuenta con servicio de guiaje.